鲁军的兵马主要由三大部分组成：第一，卢植当初调拨给孔融的六百兵马，由宗宝统领；第二，刘备、关羽、张飞的四百兵马，这部分兵马由关羽、张飞统领，刘备担任鲁国的国傅，这个职务不是军职；第三，三千五百兵马是孔明的，由太史慈、褚燕统领（典韦不单独领军，他的职责是孔明的保镖）。
如此，显而易见，孔融基本上是没有直系部队的，不过，宗宝对他还是很服从的，孔明毕竟是他的儿子，刘备也跟他关系很好，因此，不能说他只是一个“傀儡”，他对鲁军还是有很高的实际控制权的。鲁国下辖六个县（鲁、汶阳、薛、卞、邹、蕃），根据孔融的调遣：
宗宝、武安国部驻扎在鲁县；
关羽、张飞部驻扎在汶阳县；
太史慈、褚燕部分散地驻扎在薛县、卞县、邹县、蕃县。
众军进驻鲁国境内后，孔融和刘备根据孔明的提议，让士卒们分批离开鲁国，给予盘缠，令其返回老家把家人接过来定居团圆，比如太史慈，他此时就可以前去青州东莱郡黄县老家，把母亲接到鲁国定居了。此举，一来可免除士卒们思念家人之苦，二来可增强士卒们对鲁国这块土地的认可，假如有敌来犯，士卒们因为家人和家都在鲁国，自然奋勇作战、保家卫国。
在请示过豫州牧皇甫嵩并且得到皇甫嵩的批准后（皇甫嵩和卢植关系很好，皇甫嵩知道孔融是卢植旧部，自然给予关照，不过，皇甫嵩马上就要前去凉州平叛），孔融颁布了命令：
宗宝、武安国在鲁县募兵，将其部增至5000人，加紧操练以备战；
关羽、张飞在汶阳县募兵，将其部增至3000人，加紧操练以备战；
太史慈、褚燕在薛县、卞县、邹县、蕃县募兵，将其部增至10000人，加紧操练以备战。
如此，鲁军就会从来到鲁国时的4500人增至一万八千人，足以剿贼御敌、保境安民——剿贼御敌、保境安民肯定够了，但参加诸侯争霸、军阀混战肯定不够，不过，那是以后的事。
既然得到了扩军的允许，那么，鲁军自然要拿出战绩的，如果长期不打仗，鲁军的扩军之举未免惹来风言风语。跟黄巾军打了大半年的仗，孔明完全了解黄巾军除了少部分部队外，大部分都是一触即溃的土鸡瓦狗，不足为虑，更何况，鲁军拥有这么多猛将，不出去多剿点贼寇，让越多越好的地方的老百姓过上安生日子，未免浪费将才，同时，剿贼还有三大好处：一可通过实战锻炼部队，二可趁机捞点外快发点财，三可招募豪杰壮士。
鲁军拥有这么多猛将，窝在鲁国等着别人来打显然太小家子气，因此，鲁军是主动出击。
二月上旬，鲁军出击与鲁国隔着兖州山阳郡的兖州东郡，一战剿灭活动于当地的黄巾军残党王度部两千余人，斩杀王度，缴获钱粮不少；
二月下旬，鲁军出击与鲁国隔着兖州泰山郡的青州齐郡，一战剿灭活动于当地的黄巾军残党张饶（张余）部五千余人，斩杀张饶，缴获钱粮颇丰；
三月上旬，鲁军出击与鲁国隔着兖州泰山郡的青州济南郡、乐安郡，连战五天五夜消灭盘踞于二地的黄巾军残党徐和、司马俱部一万余人，斩杀徐和、司马俱，缴获钱粮不计其数；……
鲁军每次在剿贼胜利后，都把贼首和贼军头目斩首处死，至于投降和被俘的贼众，已经死了的就地掩埋，受伤的则任其自生自灭（一来，世道本就如此残酷，二来，医疗资源有限），受轻伤的和未受伤的一律押回鲁国充当劳工苦力（奴隶），用于开荒种地、修路、修筑工事、修建城垣，服役三年，期间如果表现良好，三年后就可以恢复自由，如果表现优异，还可以减少服役时间。这是孔明倡导的，这么做虽然凶横，但总比把他们全部处死得好，毕竟他们既有命也有希望。
短短一个半月的时间，鲁国周围的四五股规模较大的黄巾军余部接连被鲁军干脆利索地剿灭，不但让鲁国的安全系数得到了大大提高，也惠及鲁国周围十多个郡国，使得以上地区不再受到黄巾军余党的荼毒祸害，无数老百姓因此而交口称赞“孔国相威武”、“孔国相仁义”。
位于豫、兖、徐、青四州交界处的鲁国突然间冒出了“鲁军”这么一支如此强横的力量，使得四州境内的黄巾军余部和形形色色的匪盗贼寇都心惊胆战，还未遭到鲁军剿杀的，要么急忙搬家，要么直接投降归顺，比如，先后有两支规模不大的黄巾军余党便主动跑过来投顺，一支由裴元绍、周仓统领，另一支由杜远、廖化统领。听闻这四人姓名后，孔明暗暗地感到吃惊，他发现，自己对历史的改变已经越来越明显了，越来越多的人和事因为自己而被直接、间接地改变了命运和轨迹。考虑到根据书上记载，周仓和廖化都是蜀汉阵营的人，孔明顺水推舟，让刘备收纳了裴元绍、周仓、杜远、廖化。刘备委任裴元绍、周仓为关羽的左右副将，委任杜远、廖化为张飞的左右副将。
除了逃之夭夭和投降归顺的，也有黄巾军余党并不惧怕鲁军，继续在鲁国周边地带活动，最大的一股便是游荡在青州北海国境内的管亥部。听到“管亥”这个姓名时，孔明顿时笑了，他记得非常清楚，这个管亥正是自己老爹孔融的“老熟人”，根据书上记载，自己老爹当初被这个管亥打得一筹莫展，如今，那种事是绝不可能发生了。
三月下旬，孔明整顿兵马，准备讨伐管亥，但就在这时，有人急切地找到他，声称可以兵不血刃地解决管亥。
此人不是别人，是孙仲。
孙仲是早在宛城便投靠孔明的原黄巾军头目，他武艺不强、本事不大，还被武安国一锤砸断右臂，虽然已经康复，但右臂不可避免地留下了残疾，无法成为孔明麾下的战将，因此，他长期以来在孔明麾下只是负责打理后勤事务，倒也勤恳踏实。
“孙仲，你怎么兵不血刃地解决管亥？”孔明好奇地问道。
“回少公子，我和管亥是同乡并且关系很好。”孙仲道，“只不过我们俩后来各去一方了。我想，也许我可以说服管亥归顺少公子您。少公子您宅心仁厚、关爱部下并且还是天人神童，投效您肯定有前途，眼下，黄巾贼已经被朝廷剿灭了，只剩下一些残渣余孽还在蹦跶，继续走这条路必死无疑，管亥肯定清楚这一点。”
孔明想了想，觉得可以一试，一来，兵不血刃地解决管亥部自然是最好的，二来，管亥武艺不错，能跟关羽斗几十个回合才被斩杀，由此可见，他的武力值跟武安国是一个级别（武安国能跟吕布斗十几个回合才被击伤且没被击杀），甚至胜过武安国一筹，收服此人也有用。
“行，既然你毛遂自荐，那就试试吧！注意安全。”孔明对孙仲点点头。
“多谢少公子关心，我会尽力的。”孙仲一脸感激地道。
此事进展得十分顺利。管亥见到孙仲时自然又惊又喜，孙仲虽然不是什么能言善辩之士，但把最简单的道理阐明说清肯定是没问题的，他告诉管亥：黄巾军大势已去，继续混这条路绝对没前途，还不如跟他一样投靠孔明，孔明本事很大并且“天生异相、绝非凡人”，也不歧视黄巾军出身的人（孙仲就是最好的例子），投靠孔明肯定有前途，如果非要跟孔明硬干，那就死定了，孔明麾下有好几员猛将，个个都是牛人。
不出意外，管亥被孙仲说服了，当即决定投效孔明。在把部下遣散掉老弱病残、只保留两三千精壮后，管亥被孙仲带到鲁国，正式地投入孔明的麾下。
管亥因为出身贫寒、目不识丁，所以没有表字，孔明如法炮制，给他取了表字叫“子过”，寓意他从此改过自新。
收服管亥自然是让孔明感到高兴的一件事，毕竟他麾下又增加了一员勇将，同时，他的思路也受到启发：自己不一定要从匪盗贼寇中挑选有用之才，还可以发掘民间的“良民人才”。
打定主意的孔明立刻去找他的三伯即孔融的三哥孔谦。
孔谦生于鲁县长于鲁县，并且还是鲁县的县令，可以说，他对鲁县、鲁国和周边一带的风土人情是非常熟悉的。